Bağırsak ülseri, genellikle bulbus adı verilen mideden sonra gelen bağırsak bölümünde ve kalın bağırsaklarda görülür. Midede bulunan pilor kanalı içinde oluşan ülserler de on iki parmak ülseri olarak adlandırılır. Burada oluşan ülserler sindirim kanalındaki ülserlerin %80 ini meydana getirirler.
Mide ülserlerine oranla, on kat fazla görülmektedir. Erkeklerde görülme oranı, kadınlara göre daha fazladır. On iki parmak bağırsağında ön ve arka duvarlarda ülser gelişme riski aynıdır. Arka duvarda gelişen ülser türlerine 35-45 yaşlarında daha fazla rastlanır. Kalın bağırsaklarda görülen rahatsızlıklar Ülseratif kolit olarak adlandırılır. Bağırsak ülseri olan kişilerin üçte birinde mide ülseri görülmektedir.