Diş kökünde oluşan geçmeyen diş apsesi, genellikle ciddi bir diş çürümesi
veya yara ile ortaya çıkar. Çürük dişin iç kısmında ya da sinir ve kan
damarlarının bulunduğu pulpaya ulaşırsa pulpa ölür. Pulpadan iltihap kökün
ucundan yandaki kemiğe doğru ilerler.
Diş kökünde oluşan Geçmeyen diş apsesi, diş yada çeneye gelen ağır bir darbe sonucu dişte oluşan ciddi bir yara
nedeniyle de oluşabilir.