Diş kökü apsesi, ağız içinde bakterilerin diş köküne kadar ulaşıp, çoğalması sonucu diş kökünde apse meydana gelir. Diş kökünde apse kişide ciddi anlamda şiddetli ağrılara yol açar ve apse yapan diş kökünün bazen çekilmesi gerekebilir. Dişlerde çürüme başladığında eğer zamanında müdahale edilmezse bu çürük diş eti ve kana karışarak ilgili diş kökünde apseye sebep olur.
Diş apsesi çürüyen dişlerde diş ağrısıyla kendini belli eder. Ancak kanal tedavisi yapılmış dişlerde dolgunun düşmesi sonucu da diş kökünde apse oluşabilir. Bu durumda oluşan apse ağrılı olmayabilir. Ağız tadında değişiklik, dille problemli dişe dokunulduğunda değişik bir tat ortaya çıkmışsa dişte apse oluşmuş olabilir. Bazen diş kökü apsesi yanak ya da dişetinde şişmeyle de kendini belli edebilir.