Anaerob bakteriler, az ya da hiç oksijen olmayan bölgelerde etkili olur. Yani oksijensiz solunum yapabilen bakteri türleridir. Derin yaralarda enfekte olur, iç organlarda etkili olurlar. Anaerob bakteriler enfeksiyonlar sonucu kötü kokulu cerahate neden olur, apse ve doku yıkımına yol açar.
Genellikle ağızda, cilt yüzeyinde, gastrointestinal sistemde etkili olurlar. Bu bakteriler botulizm, tetanos gibi hastalıklarda, gazlı kangrende etkili olur. Ağız içinde diş ve diş eti enfeksiyonlarına da yol açarlar. Genellikle ciltte ve bağırsaklarda meydana gelen yaralanmalarda, hastalıklarda ya da cerrahi travmalarda bakteriler ürerler. Çoğunlukla bağışıklık sistemini etkileyen bakteriler, enfeksiyona neden olurlar.
